Isolierung und Analyse von HLA-Klasse-I-Liganden aus soliden Tumoren und Tumorzellinien

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URI: http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:21-opus-8152
http://hdl.handle.net/10900/44356
Dokumentart: PhDThesis
Date: 2003
Language: German
Faculty: 4 Medizinische Fakultät
Department: Sonstige
Advisor: Rammensee, H.-G.
Day of Oral Examination: 2003-06-18
DDC Classifikation: 610 - Medicine and health
Keywords: Immunologie , Tumor , MHC Klasse I , Ligand
Other Keywords: MHC-Klasse-I-Liganden , Epitopvorhersage , Peptidmotive , Immunpräzipitation , Peptide
CTL , MHC-class-I-ligands , tumor , epitope prediction , peptide motifs , immunoprecipitation
License: http://tobias-lib.uni-tuebingen.de/doku/lic_mit_pod.php?la=de http://tobias-lib.uni-tuebingen.de/doku/lic_mit_pod.php?la=en
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Inhaltszusammenfassung:

Das Projekt, in das die vorliegende Arbeit eingebunden ist, beschäftigt sich schon seit Jahren mit der Identifizierung von tumorspezifischen MHC-Klasse-I-Liganden für möglichst viele HLA-Allele. Diese Epitope sollen in Anschlußprojekten in der spezifischen Immuntherapie eingesetzt werden. Der klassische Weg für die CTL-Epitop-Identifizierung geht primär über das Etablieren von CTL-Klonen gegen Tumorzellinien und später wird versucht, das erkannte Epitop zu identifizieren. Hier wird eine Methode benutzt, die T-Zell-unabhängig arbeitet. Sie verbindet verschiedene Verfahren: · Epitopvorhersage durch Peptidmotive · Peptidextraktion · HPLC–massenspektrometrische-Analyse.

Abstract:

CD8+ T lymphocytes recognize their antigens as MHC-class-I-associated peptides. Our T cell independent approach for the identification of peptides derived from tumor gene products combines several methods: · epitope prediction using peptide motifs · immunoprecipitation of MHC-peptide complexes followed by acid extraction of peptides from gastrointestinal tumors or tumor cell lines · analysis by nanocapillary HPLC (high performance liquid chromatography) mass spectrometry. The aim is the characterization of new tumor-associated epitopes from gastrointestinal tumor tissue for different HLA-alleles. Such MHC-I-restricted peptides might be used for specific immune therapy employing tumor-directed cytotoxic T lymphocytes that lyse tumor cells presenting the newly characterized peptides.

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